天然水晶與合成水晶常從顏色、種晶、包裹體特徵及雙晶現象來加以區分。近年來還使用紅外光譜儀，通過測定水晶中的OH和H2O的吸收峰來區別天然與合成水晶。
1肉眼觀察
天然水晶呈稜柱狀、柱面有橫紋；而合成水晶呈扁平棒狀、柱面有特殊的魚磷狀生長紋、無雙晶等，且晶體中心有一平行C軸的籽晶。天然水晶常含有星點狀、雲霧狀的氣液包裹體。合成水晶則透明度較高，合成水晶平行籽晶有桌面灰塵狀固態包裹替，並有圓、橢圓形小氣泡。天然水晶較合成水晶更具涼感。
2儀器檢測
用偏光儀檢測，在正交偏光鏡下，呈白、灰色並有明暗變化者為天然水晶；而有虹彩或呈紫藍色者多為合成水晶。但天然水晶中個別垂直光軸者可有虹彩現象。根據經驗，一串水晶項鏈，在正交偏光鏡下，僅有2~3個具虹彩現象，則說明是天然水晶；反之，如果大部分都具有虹彩現象，則說明是合成水晶。 |
